1、犯罪动机不同。寻衅滋事罪主如果为了耍威风、追求不一般的刺激；聚众扰乱社会秩序罪是为了争取个人不适当的需要。

2、寻衅滋事罪在客观方面表现为随便殴打别人，情节恶劣的行为，或者追逐、拦截、辱骂别人，情节恶劣的行为，或者强拿硬要或者任意毁损、占用公私财物，情节紧急的行为，或者在公共场合起哄闹事，导致公共场合秩序紧急混乱的行为；聚众扰乱社会秩序罪在客观方面表现为扰乱社会秩序，情节紧急，导致工作、生产、营业和教学、科研、医疗没办法进行，导致紧急损失的。

3、寻衅滋事罪不需要聚众；聚众扰乱社会秩序罪需要是多人以上以聚众形式出现。

4、寻衅滋事罪的所有参与者都要以本罪追究刑事责任；聚众扰乱社会秩序罪只追究最重要分子和积极参加者的刑事责任。